j9九游会真人游戏第一品牌--信誉保证

 

 

转录组学研讨

 

 

概述

 

    转录组是指某个物种的特定构造或细胞在某终身理功效形态下一切转录产品的聚集。高通量转录组测序是指使用高通量测序技能对cDNA举行测序从而失掉一个样品中一切RNA的信息,在基因组序列拼接正文、样品间基因转录差别表达及其功效研讨等方面研讨中有紧张作用。转录组测序已普遍使用于底子研讨、临床诊断和药物研发等范畴。已完成包罗人、虫豸、寄生虫、动物、鱼类和微生物等多个差别物种的转录组测序和剖析事情。

 


研讨内容

 

 依据实行目标,构建种种cDNA文库,使用Pacbio体系举行全长cDNA测序,超长reads读长,一次性失掉全长转录本,差别与短reads拼接,取得最正确编码序列,有利于前期功效剖析

 转录组测序:有参考基因组转录组测序(transcriptome resequencing)/无参考基因组转录组测序(de novo transcriptome Sequencing)。

 序列拼接/基因展望/功效正文/基因表达量剖析/代谢途径/GO剖析等根本生物信息学剖析

 本性化生物信息学剖析

 


技能特点

 

 MiSeq测序可取得双向600bp reads读长,高达50×以上的掩盖率,是无参考基因组物种转录组测序的最佳选择

 Pacbio具有超长读长上风,联合共同全长转录本建库技能,可取得更多低品貌表达的全长转录本信息;借助Illimina HiSeq平台的高掩盖度数据,可对样本转录本表达状况举行评价

 Illimina HiSeq单次测序的数据量大,高掩盖率,检测到更低品貌的转录本,在已知基因组序列物种的转录组剖析中更具有上风

 454测序的序列均匀读长400-500bp,较长的读长便于拼接,从而取得更好的数据。在未知基因组序列物种的转录组剖析中更占据上风

 依据客户要求举行差别深度测序,可检测到低品貌表达的基因

 


技能道路

 

 

 


生物信息剖析

 

 


乐成案例

 

 已完成包罗人,虫豸,寄生虫,动物,鱼类和微生物等近百种差别物种的转录组测序和剖析事情